ОБЩА ИНФОРМАЦИЯ
SARS-CoV-2/UK/SA Variant Triplex кит е качествен анализ за детекция на варианти на вирусна РНК на SARS-CoV-2, базиран на Real-Time RT-PCR технологията. Китът се използва върху предварително екстрахирани НК проби, като за употребяването му е нужен Real-Time PCR термоциклер. Резултатите от използването на кита позволяват да се детектира присъствието на SARS-CoV-2 и да се различи между VOC202012/01 вариантът (известен още и като "английският вариант") или 501Y.V2 вариантът (известен още като "южноафриканският" или "бразилски" вариант).
ПРИНЦИП НА ТЕСТА
PCR системата на SARS-CoV-2 / UK / SA Variant Triplex теста амплифицира конкретно 2 целеви последователности на SARS-CoV-2, разположени върху последователността, кодираща нуклеокапсидния (N) протеин и гена, кодиращ РНК-зависимата РНК полимераза (наречена RdRP). Тези целеви последователности са специфични за щама SARS-CoV-2. За да се скринират и идентифицират вариантите, анализът амплифицира две цели последователности на нивото на кодиращата последователност на spike протеина (S), като едната е специфична и за двата варианта VOC202012 / 01 и 501Y.V2, а другата е специфична само за варианта VOC202012 / 01. SARSCoV-2 / UK / SA Variant Triplex е триплекс качествена система, която позволява едновременното амлифициране на целевите РНК в една реакция. Праймерите и двойно маркираните сонди са изградени в специфичен регион, позволяващ чувствително и специфично амплифициране и детекция на вирусната РНК на SARS-CoV-2 и на варианти, ако те присъстват в пробата.
Анализът SARS-CoV-2 / UK / SA Variant Triplex е PCR, който позволява да се скринират положителни проби на SARS-CoV-2. Следователно трябва да се направи първоначален PCR, използван за определяне на присъствието на SARS-Cov-2, преди SARS-CoV-2 / UK / SA Variant Triplex анализът.
Присъствието на нуклеинова киселина е сигнализирано чрез увеличение на флуоресценцията, заради хидролизата на сондата по време на амплификация. Флуоресцентните сигнали за амплификация на специфичните сонди на N и RdRP гените се измерват в каналът Cy5 (N и RdRP); измерва се сигналът за детекция на вариант VOC202012 / 01 както в канала FAM ™ (Spike Del69-70), така и в канала VIC® / HEX ™ (Spike N501Y), докато 501Y.V2 вариантите се измерват само в VIC® / HEX ™ канала (N501Y).
МАТЕРИАЛИ И РЕАГЕНТИ
ИНТЕРПРЕТАЦИЯ НА РЕЗУЛТАТИ
Наличието или отсъствието на SARS-CoV-2 РНК в тестваната проба се определя качествено благодарение на получени стойности на Cq (цикъл на количествено определяне) за всяка проба.
За всяка анализирана проба резултатите трябва да се интерпретират съгласно следните критерии:Сигналът се счита за положителен, ако има засичане на Cq и характерна крива.
- Отсъствието на Cq съответства на отрицателна проба или на инхибирана проба.
- Cq, равен или по-висок на 36 цикъла за Cy5 SARS-CoV-2, съответства на проба „под лимита на детекция “и не трябва да се взима предвид.
ЧУВСТВИТЕЛНОСТ И СПЕЦИФИЧНОСТ
1. Аналитична чувствителност - лимит на детекция
Чувствителността на теста е 10 копия / PCR за целите Del69-70 и N501Y.
2. Клинично представяне
Относителна чувствителност: 100% (44/44)
Относителна специфичност: 100% (44/44)
CE-IVD маркиран